El Museo Arqueológico Parroquial se gestó gracias a D. Francisco Domínguez Fernández, arcipreste de la ciudad y párroco de la iglesia de Santa María, quien fue coleccionando piezas arqueológicas procedentes del término municipal de Écija, que llegaban a la parroquia gracias a las donaciones de los vecinos de la localidad. 

El Museo fue creado por decreto del Excmo. señor cardenal D. Pedro Segura y Sáez, arzobispo de Sevilla, el 19 de diciembre de 1944, indicando «para que data ocasiones et opportunitate, vaya reuniendo en alguna galería o dependencia de la Iglesia Matriz aquellos objetos que, aunque no sean religiosos deban por su valor histórico, arqueológico o artístico el ser conservados debidamente, asesorándose para ello de personas de toda competencia en el asunto». 
(Fuente: Antonio Martín Pradas – Inmaculada Carrasco Gómez)